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银河官网app:并在世界上首次绘制了蚕种超级泛基因组图谱
时间:2022/10/10 11:08:03 作者: 来源: 浏览:0 评论:0内容摘要:西南大学发布消息,蚕基因组生物学国家重点实验室团队完成了蚕大规模种质资源的基因组分析,在世界上首次绘制了蚕的超级泛基因组图,并率先创建了“数字蚕”基因库,使蚕学科进入信息时代,开启了中国蚕业基因设计和育种的大门。蚕是重要的经济昆虫和新兴的模式生物,但在此之前,仅靠单个参考基因组和部分重测序,不足以支撑基因组变异和优良基...西南大学发布消息,蚕基因组生物学国家重点实验室团队完成了蚕大规模种质资源的基因组分析,在世界上首次绘制了蚕的超级泛基因组图,并率先创建了“数字蚕”基因库,使蚕学科进入信息时代,开启了中国蚕业基因设计和育种的大门。蚕是重要的经济昆虫和新兴的模式生物,但在此之前,仅靠单个参考基因组和部分重测序,不足以支撑基因组变异和优良基因的深度挖掘,尤其是分子育种。因此,对家蚕种质资源的基因组进行数字化,构建家蚕超级泛基因组图谱就显得尤为重要。
家蚕基因组生物学国家重银河官网app点实验室主任、国家养蚕产业技术体系首席科学家戴芳银教授,历时4年对1078份家蚕种质资源进行了深度测序,并在世界上首次绘制了蚕种超级泛基因组图谱。
“这1078份家蚕种质资源覆盖了世界‘丝绸之路’的主要蚕种区,覆盖了90%以上的世界蚕代表性种质资源,样本量大,覆盖面广。”戴方银教授介绍,这一“千家蚕基因组”包括47种野蚕、205种家蚕、194种实用种和632种突变体。
基因组是生物体所有遗传物质的总和,而泛基因组是指一个物种内所有基因组信息的总和,它所涵盖的遗传多样性比单个参考基因组要多。自2003年西南大学完成家蚕基因组框架图以来,科学界一直在对家蚕基因组进行测序研究,希望绘制出一幅更完整、更深入的“精细图谱”。然而,以往家蚕种群基因组学研究的样本数只有几十个或100多个,且都是基于二代测序技术,测序阅读长度短,样本量小,获得的信息有限。随着三代测序技术的成熟,泛基因组研究得以实现。
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